

深圳華大基因研究院8日表示,已研製完成德國的出血性大腸桿菌檢測試劑盒,並免費向全球疾病控制和研究機構提供檢測方案和引物信息。
自5月中旬德國大腸桿菌疫情爆發以來,已對德國的公眾健康造成嚴重的危害,疫情也正陸續蔓延至歐洲各地。
華大早前公布大腸桿菌基因組序列信息。IonTorrent數據和基於Illumina公司Hiseq測序平臺新產生的數據,並進行序列拼接,從而得到第一個真正意義上基於從頭測序的組裝結果。也證實該大腸桿菌含有來自腸出血性大腸桿菌(EHEC)和腸黏附性大腸桿菌(EAEC)的致病基因。
基於之前的發現,華大於7日驗證完成可快速檢測該大腸桿菌菌株的PCR診斷方案。該診斷方法主要通過兩對特異性引物的擴增,而鑒定出與黏附性及出血性相關的基因。該方法可在收到樣品后2-3小時內提供診斷結果,其對疫情監控和致病病菌的檢測起著重要作用。
華大基因對試劑盒的靈敏度和特異性進行數據分析及實驗測試,證明了該檢測方案具有高度特異性。靈敏度實驗檢測結果也表明,該方法在DNA濃度低至約1皮克(10-12克)的反應體系中仍可檢測出該菌株。更多的驗證試驗將會在本周繼續開展。