在台灣，立法院三讀通過食品衛生管理法修正案，禁止美國牛肉六個高風險部位進口，管理法明定「牛隻之頭骨、腦、眼睛、脊髓、絞肉、內臟，及其他相關製品均不得進口」。美國在台協會（AIT）發表聲明，對此表示遺憾，指台灣破壞身為貿易伙伴的誠信，美方未來很難與台灣達成協定，擴展雙方經貿關係。

        聲明指出，美國非常遺憾立法院決定限制美國牛肉進口，立法院決定單邊終止美方基於誠意而達成的雙邊議定書(美國牛肉輸台議定書)，等於是無視科學標準和台灣自身的風險評估報告。

        聲明指出，特別令人感到失望的是，美國長期以來一直都是台灣最重要的貿易與投資夥伴，且強力支持台灣積極參與全球貿易體系，包括支持台灣取得世界貿易組織（WTO）的會員資格，還有參加亞太經濟合作會議（APEC）。

        聲明也表示，修正案破壞台灣身為負責任貿易伙伴的誠信，將使美方未來很難與台灣達成協定，擴展與強化雙邊未來的經貿關係。

        聲明說，有鑑於雙方合作情誼以及雙邊經濟關係的重要地位，美方敦促台灣遵守承諾，遵照協議，履行牛肉議定書。