在台灣，就台美簽訂的牛肉議定書是否送立院備查，行政院長吳敦義說，「還要再斟酌」，一定會尊重國會，不會逾越法律規定。他重申政府「3管5卡」措施，強調有信心確保民眾健康安全。

        吳敦義表示，根據台美簽訂的牛肉議定書，台灣可採取一些重要行動，舉例來說，這次同意開放30月齡以下的牛，對絞肉與內臟部分，除非美國農業部依管制規定能提出證明是30月齡以下的牛且核發同意書，政府才可能相對發給進口同意書。若出口同意書發不出來，政府不可能發給進口同意書，這是從源頭根本阻絕。

        吳敦義表示，世界動物衛生組織所提的扁桃腺、迴腸末端，全球都認為是風險物質，但包括脊髓、頭、眼、腦是內臟的一部分，這部分既不能拿出30月齡以下證明，所以凡是有任何進口牛肉含有內臟與絞肉，政府會嚴格檢查。不但管源頭，也管邊境與市場，這就是「3管」。

        他說，「3管」再加上「5卡」，這些都在議定書沒有阻撓的情況下，所採取的措施，至於民間自動自發的配合，議定書是不會約束的。

        吳敦義表示，過去政府在2006年已開放美國牛肉進口，現在多了一項帶骨牛肉。部分民眾有疑慮的內臟部分，採「3管5卡」措施後，源頭沒了，政府有信心確保民眾健康安全，絕不打折。

        媒體詢問議定書是否送立院備查，他說，「還要再斟酌」，如果依外交部所擬的辦法，議定書生效後先報行政院核備，生效後送立法院查照，但這只是外交部所擬的準則。行政院一定會尊重國會，依法要送立法院審議或查照的就會送，不會逾越法律規定。