南京市與台北縣將在中醫肛腸、脊柱手術、人工關節、肝病防治、心胸外科、心血管內科等範圍的臨床與實驗領域、醫務管理、病人安全上開展交流與合作。

        在教學與培訓方面，兩地將選派醫師與醫務管理人員短期互訪進修學習；兩地知名專家將可互訪講學，並在各類學術會議上授課。

        在學術會議方面，兩地將聯合舉辦兩岸間醫療、公共衛生、醫務管理等學術會議，促進兩岸學術合作。

        在科學研究方面，兩地將合理共用實驗室和臨床研究設施，聯合擬寫在合作框架內的學術論文，共用經合作產生的知識產權，爭取與醫療產業合作，實現高水準研究成果的應用轉化。

        在諮詢服務方面，兩地將基於研究與應用的經驗與成果，建立網絡平臺，提供專題教學、臨床諮詢和專家問答服務。