新政府總部九個地方的水樣本，驗出退伍軍人桿菌，包括行政長官辦公室及局長私人洗手間等六處地方，以及東西翼的咖啡室、食堂及立法會的廚房。在政府總部辦公的特首及官員，均表示不擔心受影響。但有立法會議員希望當局盡快查清來源。
衞生防護中心3日公布初步化驗結果資料，再多5個高官辦公室發現退伍軍人症桿菌，包括行政長官辦公室、財經事務及庫務局局長辦公室（政府總部西座24樓）、勞工及福利局局長辦公室（政府總部西座10樓）、公務員事務局局長辦公室（政府總部西座9樓）、運輸及房屋局局長辦公室（政府總部東座22樓）及保安局局長辦公室（政府總部東座10樓）內的私人洗手間。
其餘證實含菌的水樣本來自其他的地點，包括立法會綜合大樓的宴會廳廚房水龍頭、政府總部一樓的食堂廚房水龍頭及東座二樓平台咖啡室的一個水龍頭。
衞生防護中心表示，現時的化驗結果屬初步結果，仍有待最終的化驗結果。
衞生防護中心總監曾浩輝表示，雖然新政府總部多個辦公室的水樣本，驗出退伍軍人桿菌，這種菌有水就會存在，不一定爆發退伍軍人症，有關官員及職員，毋須暫停上班或停用辦公室，只需要加強清潔，及增設消毒設施。
中心已建議大廈管理處採取適當的跟進工作，包括消毒及感染控制措施。衞生防護中心稍後會到該大廈抽取在消毒後的水樣本再作化驗。
傳染病科醫生勞永樂指出，不排除是建築期間有輸水喉管受污染，加上水管內長期積水，在多個地方藏菌，但亦可能是輸水系統出現設計問題，令水長時間處於靜止狀態，因而滋生細菌。他相信大規模爆發的機會不大，亦不可掉以輕心。
立法會秘書處向全體議員及職員發出電郵，今日會就大樓的供水系統作全面消毒，之後再進行水質化驗，目前呼籲同事飲用蒸餾水。
另外，特首曾蔭權如常返回行政長官辦公室工作，未有受到發現退伍軍人菌的影響。發展局長林鄭月娥及商務及經濟發展局長蘇錦樑表示，並不擔心，他會注意個人衛生，認為新總部適合繼續辦工。保安局局長李少光表示，大家都很健康，多謝關心。
