在台灣，颱風「芭瑪」4日上午已移到巴士海峽，出現滯留打轉現象，暴風圈晚上就將影響恆春半島陸地，中央氣象局預報中心清晨5時30分發布陸上颱風警報，同時發布豪雨特報，北部及東半部民眾須嚴防豪雨出現。而88水災中受重創的阿里山鄉來吉村，320名村民上午撤離下山，整個來吉村宛如一座空城。

        嘉義縣政府表示，發出颱風陸上警報後，包括阿里山、梅山、番路、竹崎、中埔和大埔6鄉鎮山區部落，在88水災時受創嚴重，至少2696人撤離。其中，在88水災中受重創的阿里山鄉來吉村，上午先行撤離，320名村民陸續下山。

        來吉村民清一色是鄒族人，他們有些自行開車，有些搭乘縣府提供的交通車，從塔山下出發，告別心目中的聖山後，跨過阿里山溪，繞道雲林縣草嶺、雲林縣古坑鄉，再進入嘉義縣梅山鄉，中午前陸續抵達水上鄉中庄營區及朴子配天宮。山區6個鄉公所已準備30處臨時安置所，儲備物資至少足夠7至10天。

        來吉村長石忠勇表示，雖然昨天是中秋節，山區月色皎潔，但村民一想到今天上午就要撤離家園，大多無心賞月，加上凌晨1時36分又被地震驚醒，大家有如驚弓之鳥，很多人一夜失眠。大家只希望颱風不要來，讓他們能夠早日回去重整家園。

        而屏東縣政府昨天撤離危險山區部落後，今天上午起也進行淹水區林邊鄉的預防性疏散，共181位老人、生病和殘障者被安置到老人之家等老人安養中心。下午3時將進行一般民眾的預防性疏散，不採強制性，民眾如住在平房或是低漥處，認為必須疏散的，軍方將把他們送到枋山加祿堂營區。

        行政院長吳敦義上午視察中央氣象局時表示，政府啟動全民防災、救災機制，雖然防救災以地方政府為主體，總統馬英九指示中央政府盡一切力量支援地方，確保人民生命財產安全，所以昨天國軍已在高度敏感區預置兵力，並做預防撤離。

        吳敦義認為，如果颱風真正侵襲台灣，災情會比88風災災害輕，如果無災情，就當作地方與中央，民間與軍警綿密有效的演習。他也特別提到，過去颱風來襲時很多民眾無法接受的遷村、撤離家園，這次反而主動積極要求撤離，顯示民眾防災、救災意識提高。

        吳敦義又說，多年來的經驗，颱風風勢對台灣造成的損害較小，反而是超大豪雨、暴雨造成的損害令人創痛，未來防颱時，更要防暴雨的侵害。

        中央氣象局預報員蕭家森清晨表示，芭瑪颱風未來將在巴士海峽呈現滯留現象，時間可能長達數天，雖然其暴風圈可能影響恆春半島時間變慢，但其外圍環流已開始實際影響恆春半島及台灣北部、東半部，稍後會有局部性豪雨、大豪雨，山區並有超大豪雨機會，預料包括台北、宜蘭、花蓮及台東山區總雨量最高可達1100毫米，南投、屏東山區最高500毫米，新竹、嘉義、高雄山區最高400毫米，苗栗、台中、台南山區最高300毫米。

        為因應颱風來襲，空軍司令部在嘉義基地開設前進指揮所，全天候待命，只要天氣狀況許可，將在收到危難訊息10分鐘內起飛救援。國防部則表示，現有兵力難滿足地方政府防災需求，兼顧官兵權益與救災任務，國防部在颱風侵襲前36小時彈性調整官兵休假，是不得已做法，請民眾體諒。